Анатомический Музей Уоррена возник из пожертвования Джоном Коллинзом Уорреном (1778-1856) своей личной преподавательской и научной коллекцией. Уоррен собирал анатомические и патологические препараты для обучения своих студентов-медиков. Его сбор начался еще в 1799 году, и он постепенно расширил свою коллекцию. Когда Уоррен ушёл с поста профессора Гарвардского университета в 1847 году, он представил большую часть своей коллекции в университете с пожертвованием от $ 5000 для поддержания её сохранности.